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Post Doctorant-es H/F: Outils ADNe pour la caractérisation de la biodiversité aquatique


Détail de l'offre

Informations générales

Date limite de candidature

16/08/2025

Type de recrutement

Post-doctorat

Durée du contrat

24

Description du poste

Catégorie

Catégorie A (cadre)

Poste ouvert aux :

Contractuels

Domaine / métier

SCIENCE - Chercheurs-es - Post Doctorant-es

Etat du poste

Vacant

CORPS

Post Doctorat

BAP

Non concerné

Intitulé du poste

Post Doctorant-es H/F: Outils ADNe pour la caractérisation de la biodiversité aquatique

Descriptif de l'employeur

L'IRD est un organisme de recherche public français pluridisciplinaire qui, depuis près de 80 ans, s'engage dans des partenariats équitables avec les pays du Sud et dans les Outre-mer français.


Acteur de l'agenda international pour le développement, ses priorités s'inscrivent dans la mise en œuvre des Objectifs de développement durable (ODD).


Ensemble, scientifiques et partenaires de l'Institut proposent des solutions concrètes pour répondre aux défis globaux auxquels les sociétés et la planète font face. Cette relation gagnante-gagnante fait de la science et de l'innovation des leviers majeurs du développement.


L'Institut est placé sous la double tutelle du ministère chargé de l'Enseignement supérieur et de la Recherche et de celui chargé de l’Europe et des Affaires Étrangères.

Descriptif de la structure

Le laboratoire BOREA (Biologie des Organismes et des Écosystèmes Aquatiques) étudie l’écologie et la biologie des organismes aquatiques dans des écosystèmes naturels ou anthropisés. Son objectif est de comprendre, par une approche intégrative et multidisciplinaire, l’origine, le rôle et l’évolution de la biodiversité aquatique, les interactions biotiques et les réponses aux changements globaux.


Les modèles biologiques étudiés vont des micro-organismes (bactéries, diatomées) aux métazoaires (cnidaires, mollusques, crustacés, poissons, etc.), choisis pour leur intérêt phylogénétique, écologique ou économique. Les écosystèmes concernés sont marins, côtiers et dulçaquicoles, en zones tempérées, tropicales ou polaires.


BOREA mobilise de nombreuses disciplines : biochimie, biologie moléculaire, éco-évo-dévo, endocrinologie, écophysiologie, écotoxicologie, systématique, phylogénie, écologie fonctionnelle, modélisation, biogéographie, etc.


Les recherches fondamentales menées dans l’unité s’ouvrent à des applications variées : gestion des collections, taxonomie et inventaires, bioindicateurs, conservation de la biodiversité, aquaculture, biotechnologies marines (molécules bioactives, traçabilité, biomatériaux, etc.).

Une mission attractive

Développer et adapter des protocoles d’analyse de la biodiversité aquatique par ADNe, en lien avec des partenaires du Sud, pour renforcer la coopération scientifique et les capacités locales.


Sous la responsabilité de Marc Pouilly  (UMR BOREA, IRD) et Nicolas Rabet (UMR BOREA, Sorbonne Université), en collaboration avec Dr Mattia Sacco (BOREA) et Dr Jérôme Murienne (UMR CRBE, Université de Montpellier), vos activités principales seront les suivantes:


1) Développement et adaptation de protocoles ADNe pour la caractérisation de la biodiversité aquatique dans les écosystèmes d’eau douce tropicaux.


2) Contribution à l’enrichissement des bibliothèques moléculaires régionales (poissons, microcrustacés) par la collecte, l’identification et le séquençage de spécimens.


3) Valorisation des collections muséologiques par des approches de taxonomie intégrative incluant la dimension génétique.


4) Mise en œuvre d’un suivi de la biodiversité dans le Gran Chaco (Bolivie, Argentine) via l’ADNe et construction d’indicateurs écosystémiques (assèchements, migration des poissons).


5) Formation des partenaires locaux (Sud) à l’utilisation des outils ADNe (ex. MinION) via des protocoles accessibles et contextualisés.


Activités secondaires:


1) Participation à la coordination technique des activités du projet FEF Pilcomayo et à la rédaction de rapports ou publications scientifiques.


2) Organisation et réalisation de missions de terrain de longue durée en Amérique du Sud (env. 1/an).

Conditions particulières d'exercice

L’IRD, au cours de votre parcours professionnel, vous accompagne dans le développement de vos compétences. 


L’institut met à votre disposition un panel d’outils tel que le parcours digital d’intégration, l’accès à la formation permanente, à la promotion et la mobilité.


L’IRD offre, en fonction des activités, la possibilité de télétravailler de 1 à 3 jours hebdomadaires. 


En rejoignant l’IRD, vous bénéficierez : 


·De 32 jours de congés + 13 RTT (pour un temps plein à 38h30 hebdomadaire)


·Tickets restaurants OU d’une restauration collective (en fonction du site) 


·Souscription annuelle (facultative) à l’Association des Œuvres Sociales : prestations vacances-loisirs et sportives-culturelles


·Participation à hauteur de 15€/mois pour la protection sociale

Le profil que nous recherchons

Vous avez développé les compétences suivantes :


1) Solide expertise en écologie moléculaire, en particulier sur les méthodes ADNe (métabarcoding, barcoding, extraction, amplification, analyse bioinformatique).


2) Connaissance des écosystèmes aquatiques tropicaux et des enjeux de biodiversité associés.


3) Pratique des missions de terrain dans des contextes contraints (milieux tropicaux, coopération internationale).


4) Compétences en taxonomie ou en valorisation de collections biologiques.


5) Capacité à encadrer ou former des partenaires non spécialistes sur des outils techniques (protocole, plateforme MinION, etc.).


Vous faites preuve des qualités humaines suivantes :


1) Autonomie et capacité à mener un projet de recherche en lien avec des partenaires internationaux.


2) Goût pour le travail en équipe, en contexte interculturel et interdisciplinaire.


3) Forte capacité d’adaptation en mission de terrain et dans des environnements scientifiques hétérogènes.


4) Rigueur scientifique et sens de l’organisation.


5) Bonnes aptitudes à la communication scientifique (écrite et orale) en français et en anglais, l’espagnol étant un plus.


Vous êtes titulaire d’un diplôme de niveau 8, doctorat en écologie ou biologie des organismes préciser la spécialité 


 


     Conditions d’éligibilité


·       Avoir soutenu sa thèse dans un délai de moins de 3 ans à la date de prise de poste.


·       Envoyer sa candidature (cv et lettre de motivation) sur IRD EMPLOI

Rémunération

2793

Localisation du poste

Localisation du poste

Europe, France

Ville d'affectation

Paris

Informations complémentaires

Télétravail possible

Oui

Management

Non

Demandeur

Date de vacance de l'emploi

01/12/2025

Contact RH (mail)

recrutement.idf-ouest@ird.fr