L'IRD est un organisme de recherche public français pluridisciplinaire qui, depuis près de 80 ans, s'engage dans des partenariats équitables avec les pays du Sud et dans les Outre-mer français.

Acteur de l'agenda international pour le développement, ses priorités s'inscrivent dans la mise en œuvre des Objectifs de développement durable (ODD).

Ensemble, scientifiques et partenaires de l'Institut proposent des solutions concrètes pour répondre aux défis globaux auxquels les sociétés et la planète font face. Cette relation gagnante-gagnante fait de la science et de l'innovation des leviers majeurs du développement.

L'Institut est placé sous la double tutelle du ministère chargé de l'Enseignement supérieur et de la Recherche et de celui chargé des Affaires Étrangères.

L’Unité Mixte de Recherche MIVEGEC, IRD 224, CNRS 5290, Université de Montpellier, oriente ses recherches sur l’écologie et l’évolution des systèmes infectieux et de leurs vecteurs. Les recherches, hautement intégratives, sont conduites aux interfaces entre écologie et évolution, santé et environnement, biologie et médecine, sur de nombreux modèles biologiques et à toutes les échelles spatiales et temporelles. L’Unité regroupe une centaine de chercheurs et techniciens des trois tutelles qui se répartissent en cinq départements scientifiques.

Dans le cadre du projet ERYMAP (ANR) nous étudions les parasites du paludisme en utilisant des techniques avancées de transcriptomique, de biologie cellulaire et moléculaire, de génétique et de protéomique, et les déploie dans divers contextes, y compris le laboratoire et les parasites et cellules hôtes directement prélevés chez des porteurs naturellement infectés. Nous nous intéressons particulièrement à la compréhension de l'interface hôte-pathogène et aux décisions du destin cellulaire qui sous-tendent la pathologie, la persistance et la transmission des parasites.

Sous la responsabilité d’Arthur Talman, chercheur à l’IRD, vous rejoindrez notre équipe et coordonnerez les études sur les effets des parasites du paludisme sur l'érythropoïèse. Le projet est une collaboration avec les équipes de Frédérique Verdier et Catherine Lavazec à l'Institut Cochin. Nous visons à découvrir les interactions complexes entre les parasites du paludisme et la production de globules rouges in vitro et in vivo.

Vos activités seront les suivantes :

• Diriger l'analyse des données de transcriptomique à cellule unique humaine et parasitaire.
• Développer et mettre en œuvre des pipelines informatiques pour l'analyse et l'interprétation des données de séquençage à haut débit.
• Collaborer avec une équipe multidisciplinaire de chercheurs, y compris des biologistes, des bioinformaticiens et des cliniciens.
• Diriger la préparation de manuscrits.
• Encadrer des étudiants diplômés selon les besoins.

 Votre future équipe

Nous sommes une équipe multidisciplinaire et diversifiée au sein d'un institut prolifique et passionnant qui comprend des installations de pointe, notamment un cluster de calcul haute performance. Nous nous efforçons de créer un environnement où tous les individus sont valorisés, respectés et soutenus.

L'équipe se compose de 2 techniciens de recherche, 2 post-doctorants et 3 doctorants.

Vous avez développé les compétences suivantes :

• Solide expérience en transcriptomique à cellule unique et expérience avec les outils d'analyse de données.

• Maîtrise des langages de programmation tels que R ou Python.

• Expérience des environnements de calcul haute performance.

• Excellentes compétences en résolution de problèmes et capacité à travailler de manière indépendante et en équipe.

• Solides compétences en communication écrite et orale en anglais niveau C1-C2.

• Engagement envers la diversité, l'équité et l'inclusion dans l'environnement de recherche.

• Expérience dans la recherche sur le paludisme ou l'hématopoïèse.

• Familiarité avec les méthodes statistiques pour l'analyse des données génomiques.

• Historique démontré de publications évaluées par des pairs.

Vous êtes titulaire d’un diplôme de niveau 7- 8, Master et/ ou Doctorat en bioinformatique, biologie computationnelle, génomique ou dans un domaine connexe.

Nous vous remercions de joindre à votre candidature :

• Une lettre de motivation détaillant vos intérêts et votre expérience de recherche.

• Un curriculum vitae (CV) incluant une liste de publications.

• Les coordonnées de deux références.

L’IRD, au cours de votre parcours professionnel, vous accompagne dans le développement de vos compétences.

L’institut met à votre disposition un panel d’outils tel que le parcours digital d’intégration, l’accès à la formation permanente, à la promotion et la mobilité.

L’IRD offre, en fonction des activités, la possibilité de télétravailler de 1 à 3 jours hebdomadaires.

En rejoignant l’IRD, vous bénéficierez :

• De 32 jours de congés + 13 RTT (pour un temps plein à 38h30 hebdomadaire).
• Tickets restaurants OU d’une restauration collective (en fonction du site).
• Souscription annuelle (facultative) à l’Association des Œuvres Sociales : prestations vacances-loisirs et sportives-culturelles.
• Participation à hauteur de 15€/mois pour la protection sociale.