Ingénieur en microbiologie H/F

Détail de l'offre

Informations générales

Date limite de candidature

21/08/2026

Type de recrutement

CDD

Durée du contrat

24 Mois

Description du poste

Catégorie

Catégorie A (cadre)

Poste ouvert aux :

Contractuels

Domaine / métier

SCIENCE - BAP A : Sciences du vivant, de la terre et de l’environnement - A1A41 - Ingénieur-e biologiste en analyse de données

Etat du poste

Vacant

CORPS

Ingénieur de Recherche

BAP

A

Intitulé du poste

Ingénieur en microbiologie H/F

Descriptif de l'employeur

Institut français de recherche scientifique internationale, l’IRD contribue à renforcer la résilience des sociétés face aux bouleversements globaux. Il est présent dans plus de 50 pays d’Afrique, d’Amérique latine, d’Asie et du Pacifique, ainsi qu’en France hexagonale et dans les Outre-mer.

Ses activités de recherche répondent de manière concrète à des besoins prioritaires : atténuation et adaptation aux changements climatiques, lutte contre la pauvreté et les inégalités, préservation de la biodiversité, accès aux soins, prise en compte des dynamiques sociales. Les questions de recherche sont élaborées avec les acteurs de terrain et les populations locales. Les équipes croisent les regards, les disciplines et les connaissances à travers des partenariats de long terme pour construire des solutions robustes et à fort impact. L’IRD défend une recherche qui bénéficie au plus grand nombre. Il partage les résultats de ses projets et met la science au service de l’action. Il accompagne ainsi la transformation des sociétés vers des modèles sociaux, économiques et écologiques plus justes et durables.

 

Descriptif de la structure

Vous rejoindrez l’UMR 233 TransVIHMI (Université de Montpellier-IRD-Inserm).

L’objectif principal de l’unité TransVIHMI est l’étude des spécificité microbiologiques, épidémiologiques, cliniques et sociales des infections (incluant les virus, bactéries, champignons et parasites) ayant un impact élevé pour la santé des populations du continent africain. Les principaux modèles étudiés depuis de nombreuses années sont les maladies virales émergentes (fièvres hémorragiques, Mpox, Cornavirus), le SIDA et les maladies infectieuses endémiques (tuberculose, maladies tropicales négligées).

La démarche scientifique s’appuie sur un continuum recherche, renforcement de capacités de nos partenaires du Sud et intervention, une  approche One Health, c’est-à-dire située à l’interface Humain-faune animale et Environnement, à la fois transdisciplinaire et pluridisciplinaire associant la plupart des disciplines des sciences de la Santé telles que la virologie, parasitologie, clinique, épidémiologie, santé publique et sciences sociales. Ainsi, l’unité TransVIHMI conduit des recherches intégratives et transdisciplinaires pour comprendre les mécanismes d’émergence et de diffusion des agents pathogènes dans les écosystèmes, étudier leur transmission et leurs impacts sur les populations et communautés d’hôtes et sur leur environnement, et proposer des outils et stratégies innovants pour une gestion durable des épidémies.





     

Une mission attractive


Sous la responsabilité de directeurs de recherche IRD dans l’UMR TransVIHMI, vos activités seront les suivantes :

  • Concevoir et organiser le traitement et l’analyse des données de séquençage : génotypage, matrice de distances, construction phylogénétique (méthodes probabilistes bayesiennes et de ressemblance, méthodes de distance …), dépôt des séquences générées sur les bases de données internationales. 
  • Élaborer et réaliser les analyses NGS.
  • Concevoir et participer aux analyses de biologie moléculaire : amplication génomique (PCR, qPCR), préparation des librairies avant séquençage nanopore ou illumina (MiSeq ou HiSeq), séquençage (sanger, NGS).
  • Participer aux réunions régulières du consortium organisées par l’OMSA, opérateur du projet ZOOSURSY.
  • Élaborer et rédiger les rapports d’activités associés au projet ZOOSURSY. 
  • Animer et organiser un transfert de compétences vers les partenaires au sud de TransVIHMI dans le cadre du projet.
  • Collaborer, avec l’assistante de l’unité et les autres collaborateurs impliqués dans le projet, au suivi budgétaire du projet ZOOSURSY et à l’élaboration des rapports financiers annuels.
  • En cas de nécessité, s'impliquer dans les autres activités du projet ZOOSURSY se déroulant dans les cinq pays.

 Votre future équipe

Vous rejoindrez le groupe "VIH, Ebola et autres infections virales" au sein de l’équipe 1, intitulée "Diversité génétique, Résistance, Emergence, Interface homme/faune sauvage des maladies infectieuses et du VIH", basée à la Direction régionale Occitanie de l’IRD à Montpellier.

Vous conduirez les activités du projet ZOOSURSY au Cameroun, la République de Guinée et la Republique Démocratique du Congo (RDC). Le projet ZOOSURSY, intitulé "Renforcement de la surveillance, de la détection précoce et de la prévention des maladies zoonotiques émergentes en Afrique", opéré par l’OMSA et financé par l’UE, a pour objectif principal de renforcer les systèmes de détection précoce et de surveillance de la faune et du bétail et de renforcer les services publics - notamment les services sanitaires et vétérinaires - impliqués dans la détection précoce afin de prévenir l'apparition de maladies zoonotiques à potentiel épidémique.

Le profil que nous recherchons


Vous avez développé les compétences suivantes :

  • Expertise en analyse phylogénétique et en génomique évolutive.
  • Expérience avérée en analyses NGS.
  • Utilisation des techniques de biologie moléculaire (extraction d’acides nucléiques, PCR, migration sur gel).
  • Connaissances en gestion de bases de données.
  • Connaissance en virologie.

Vous faites preuve des qualités humaines suivantes :

  • Capacité à travailler efficacement en équipe et en collaboration avec des chercheurs, ingénieurs et étudiants.
  • Excellentes compétences en communication orale et écrite, en français et en anglais.
  • Rigueur et sens de l’organisation.

 

Vous êtes titulaire d’un diplôme de niveau 7/8, Master 2 ou thèse en virologie et/ou biologie moléculaire.

 

L’IRD, au cours de votre parcours professionnel, vous accompagne dans le développement de vos compétences.

L’institut met à votre disposition un panel d’outils tel que le parcours digital d’intégration, l’accès à la formation permanente, à la promotion et la mobilité.

L’IRD offre, en fonction des activités, la possibilité de télétravailler de 1 à 3 jours hebdomadaires.

En rejoignant l’IRD, vous bénéficierez :

  • De 32 jours de congés + 13 RTT (pour un temps plein à 38h30 hebdomadaire).
  • Une restauration collective.
  • Souscription annuelle (facultative) à l’Association des Œuvres Sociales : prestations vacances-loisirs et sportives-culturelles.
  • D’une affiliation à la protection sociale complémentaire MGEN, offrant une couverture santé et prévoyance de qualité.
  • D’un cadre de travail agréable, proche de la nature, desservi par le Tram ligne 5 et accessible en vélo et bénéficiant d’un système de co-voiturage (convention mobilité signée avec la métropole).

 

Nos recrutements sont fondés sur les compétences, sans distinction d’origine, d’âge ou de genre et tous nos postes sont ouverts aux personnes en situation de handicap.

Localisation du poste

Localisation du poste

Europe, France, Occitanie, Hérault (34)

Ville d'affectation

MONTPELLIER

Informations complémentaires

Télétravail possible

Oui

Management

Non

Demandeur

Date de vacance de l'emploi

01/10/2026

Contact RH (mail)

recrutement.dr-occitanie@ird.fr