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Chercheur en Microbiologie F/H


Détail de l'offre

Informations générales

Date limite de candidature

04/08/2025

Type de recrutement

CDD

Durée du contrat

36 Mois

Description du poste

Catégorie

Catégorie A (cadre)

Poste ouvert aux :

Contractuels

Domaine / métier

SCIENCE - Chercheurs-es - Post Doctorant-es

Etat du poste

Vacant

CORPS

Post Doctorat

BAP

Recherche

Intitulé du poste

Chercheur en Microbiologie F/H

Descriptif de l'employeur

L'IRD est un organisme de recherche public français pluridisciplinaire qui, depuis près de 80 ans, s'engage dans des partenariats équitables avec les pays du Sud et dans les Outre-mer français.

Acteur de l'agenda international pour le développement, ses priorités s'inscrivent dans la mise en œuvre des Objectifs de développement durable (ODD).

Ensemble, scientifiques et partenaires de l'Institut proposent des solutions concrètes pour répondre aux défis globaux auxquels les sociétés et la planète font face. Cette relation gagnante-gagnante fait de la science et de l'innovation des leviers majeurs du développement.

L'Institut est placé sous la double tutelle du ministère chargé de l'Enseignement supérieur et de la Recherche et de celui chargé des Affaires Étrangères.

 

L'IRD en 230 secondes

Descriptif de la structure

Vous rejoindrez l’UMR 233 TransVIHMI (Université de Montpellier-IRD-Inserm)

L’objectif principal de l’unité TransVIHMI est l’étude des spécificités microbiologiques, épidémiologiques, cliniques et sociales des infections (incluant les virus, bactéries, champignons et parasites) ayant un impact élevé pour la santé des populations du continent africain. Les principaux modèles étudiés depuis de nombreuses années sont les maladies virales émergentes (fièvres hémorragiques, Mpox, Cornavirus …), le SIDA et les maladies infectieuses endémiques (tuberculose, maladies tropicales négligées).

 

La démarche scientifique s’appuie sur un continuum recherche, renforcement de capacités de nos partenaires du Sud et intervention, une  approche One Health, c’est-à-dire située à l’interface Humain-faune animale et Environnement, à la fois transdisciplinaire et pluridisciplinaire associant la plupart des disciplines des sciences de la Santé telles que la virologie, parasitologie, clinique, épidémiologie, santé publique et sciences sociales. Ainsi, l’unité TransVIHMI conduit des recherches intégratives et transdisciplinaires pour comprendre les mécanismes d’émergence et de diffusion des agents pathogènes dans les écosystèmes, étudier leur transmission et leurs impacts sur les populations et communautés d’hôtes et sur leur environnement, et proposer des outils et stratégies innovants pour une gestion durable des épidémies.

 

 

Une mission attractive

Sous la responsabilité de Ahidjo Ayouba chercheur et en étroite collaboration avec Eric Leroy et Martine Peeters, votre mission sera de conduire et superviser les activités scientifiques définies dans le projet ZOOSURSY au Cameroun, Guinée et en République démocratique du Congo (RDC) et en assurer la gestion administrative.

vos activités seront les suivantes :

  • Superviser et/ou participer aux analyses de laboratoire : diagnostic moléculaire, sérologie multiplex, séquençage NGS (Illumina, Nanopore) et développer les SOP pour les partenaires et membres du consortium
  • Participer aux réunions régulières du consortium organisées par l’OMSA, opérateur du projet ZOOSURSY
  • Assurer l’encadrement des étudiants en Master et accompagner les étudiants en thèse des pays du sud dans le cadre du projet ZOOSURSY
  • Rédiger les rapports d’activités associés au projet ZOOSURSY et valoriser les résultats obtenus par des participations à des congrés nationaux et internationaux et la rédaction d’articles scientifiques
  • Participer aux missions de terrain de collecte de matériel biologique et transférer les nouvelles technologies (moléculaire et sérologie) dans les laboratoires des partenaires au CERFIG (Guinée),CREMER (Cameroun) et INRB (RDC).
  • Participer, avec l’assistante de l’unité, au suivi budgétaire du projet ZOOSURSY et à l’élaboration des rapports financiers annuels.
  • En cas de nécessité, participer aux activités du projet ZOOSURSY se déroulant dans les deux autres pays où TransVIHMI est impliquée, le Gabon et la République du Congo.

 

 Votre future équipe

 

Vous rejoindrez le groupe "VIH, Ebola et autres infections virales" au sein de l’équipe 1, intitulée "Diversité génétique, Résistance, Emergence, Interface homme/faune sauvage des maladies infectieuses et du VIH", basée à la Direction régionale Occitanie de l’IRD à Montpellier.

 

 

Au sein de l’équipe 1, vous conduirez les activités du projet ZOOSURSY au Cameroun, Guinée et en République démocratique du Congo. Le projet ZOOSURSY, intitulé "Renforcement de la surveillance, de la détection précoce et de la prévention des maladies zoonotiques émergentes en Afrique", opéré par l’OMSA et financé par l’UE, a pour objectif principal de renforcer les systèmes de détection précoce et de surveillance de la faune et du bétail et de renforcer les services publics - notamment les services sanitaires et vétérinaires - impliqués dans la détection précoce afin de prévenir l'apparition de maladies zoonotiques à potentiel épidémique.

 

Le profil que nous recherchons

Vous avez développé les compétences suivantes :

 

  • Ecologie, épidémiologie, phylogénie ou modélisation (de préférence combinée) de maladies émérgentes d’origine zooonotiques.

  • Participation à des études de terrain en Afrique (collecte d’echantillons) pour la surveilllance  mais aussi pendant les investigations d’émérgences avec des pathogènes  comme Ebola, Mpox, Marburg.

  • Formation et transférer les technologies de collectes surle terrain ainsi que les techniques moleculaire et serologique aux laboratoires participants en Guinée, au Cameroun et en République démocratique du Congo.

  • Technologies de séquençage de nouvelle génération (Illumina, MinION) et l'analyse bioinformatique.

  • Expérience de terrain et en laboratoire des technologies de séquençage et serologie de nouvelle génération pour détecter et caractériser les virus chez l'humain et/ou la faune sauvage.

  • Les techniques sérologies multiplex.


Vous faites preuves des qualités humaines suivantes : 

  • Capacité d’adaptation à un cadre professionnel et à un environnement géographique et culturel pouvant être difficles et différents du milieu d’origine.

  • Rigueur et sens de l’organisation.

  • Relationnel et sens du travail en équipe.

  • Engagement et enthousiasme.
  • Une expérience du travail en Afrique serait un plus.

     

     

 

Vous êtes titulaire d’un diplôme de niveau 8 : Doctorat

 

 

 

 

Localisation du poste

Localisation du poste

Europe, France, Occitanie, Hérault (34)

Ville d'affectation

Montpellier

Informations complémentaires

Télétravail possible

Oui

Management

Non

Demandeur

Date de vacance de l'emploi

01/11/2025