Export RSS des offres - Seulement les offres à la une : Non / Métier : SCIENCE - BAP A : Sciences du vivant, de la terre et de l’environnement

2026-820 - A2A43 - Ingénieur-e en techniques biologiques

Fri, 04 Sep 2026 12:42:56 Z

Domaine / métier : SCIENCE - BAP A : Sciences du vivant, de la terre et de l’environnement/A2A43 - Ingénieur-e en techniques biologiques
Poste ouvert aux : : Contractuels
Description du poste :
La mission consistera à gérer et assister la collecte, l’analyse et la valorisation des données biologiques et environnementales du projet MEDDI « Connaissance et gestion des écosystèmes coralliens mésophotiques du sud-ouest de l’océan Indien ». Sous la responsabilité de M. Mehdi ADJEROUD, Directeur de Recherche à l’IRD au sein de l’UMR ENTROPIE et responsable du projet MEDDI, vos activités seront les suivantes : - Mise en œuvre des protocoles d’échantillonnage, organisation et coordination des activités de terrain - Participation à l’analyse des échantillons - Bancarisation des données biologiques et environnementales - Analyses statistiques des données - Suivi des aspects scientifiques (livrables) du projet. Le projet MEDDI se propose de développer trois actions liées (i) à l’inventaire et à la caractérisation des communautés benthiques et ichtyologiques des écosystèmes coralliens mésophotiques (ECM) de La Réunion et de Madagascar (Toliara, Nosy-Be), (ii) à la dynamique et aux processus démographiques des communautés coralliennes, et (iii) aux mesures de gestion et de conservation de ces ECM. En testant l’hypothèse de zone refuge, ce projet permettra de mieux appréhender l’évolution des écosystèmes côtiers dans un contexte de changement climatique.

Vous avez développé les compétences suivantes : - Connaissances théoriques et pratiques en biologie/écologie marine - Connaissances des équipements de mesure de paramètres environnementaux (sondes) - Connaissance des outils informatiques de traitement de données et de bureautique - Pratique de la plongée scientifique en scaphandre autonome souhaitée - Intérêt pour le travail en équipe Vous faites preuve des qualités humaines suivantes : - Sens de l’organisation - Capacité à travailler en équipe et évaluer les attentes et besoins des publics concernés - Autonomie, rigueur et esprit d’initiative - Importante ouverture d’esprit - Capacité de rédaction et d’analyse Vous êtes titulaire d’un diplôme de niveau Doctorat dans le domaine de la biologie/écologie marine. Le travail pourra comporter des missions embarquées à la journée.

2026-819 - A2A43 - Ingénieur-e en techniques biologiques H/F

Thu, 03 Sep 2026 12:23:11 Z

Domaine / métier : SCIENCE - BAP A : Sciences du vivant, de la terre et de l’environnement/A2A43 - Ingénieur-e en techniques biologiques
Poste ouvert aux : : Contractuels
Description du poste :
La mission consistera à appuyer la mise en œuvre du projet MEDDI « Connaissance et gestion des écosystèmes coralliens mésophotiques du sud-ouest de l’océan Indien », en assistant la gestion administrative et scientifique du projet. Sous la responsabilité de M. Mehdi ADJEROUD, Directeur de Recherche à l’IRD au sein de l’UMR ENTROPIE et responsable du projet MEDDI, vos activités seront les suivantes : - Aide à la collecte, la mise en valeur, et à la bancarisation des données collectées - Organisation et appui des activités de terrain - Suivi de la réalisation des livrables, et de la communication autour du projet - Coordination entre les partenaires du projet - Suivi des aspects administratifs, budgétaires et réglementaires du projet. Le projet MEDDI se propose de développer trois actions liées (i) à l’inventaire et à la caractérisation des communautés benthiques et ichtyologiques des écosystèmes coralliens mésophotiques (ECM) de La Réunion et de Madagascar (Toliara, Nosy-Be), (ii) à la dynamique et aux processus démographiques des communautés coralliennes, et (iii) aux mesures de gestion et de conservation de ces ECM. En testant l’hypothèse de zone refuge, ce projet permettra de mieux appréhender l’évolution des écosystèmes côtiers dans un contexte de changement climatique.

Vous avez développé les compétences suivantes : - Connaissances théoriques et pratiques en biologie/écologie marine - Connaissances du fonctionnement administratif des instituts et unités de recherche - Connaissance des outils informatiques de traitement de données et de bureautique - Savoir communiquer, transmettre et présenter des résultats - Intérêt pour le travail en équipe Vous faites preuve des qualités humaines suivantes : - Sens de l’organisation, autonomie, rigueur et esprit d’initiative - Capacité à travailler en équipe et évaluer les attentes et besoins des publics concernés - Importante ouverture d’esprit - Capacité d’animation d’équipe - Capacité de rédaction et d’analyse.

2026-811 - Ingénieur.e de recherche en éco-épidémiologie H/F

Thu, 03 Sep 2026 12:05:18 Z

Domaine / métier : SCIENCE - BAP A : Sciences du vivant, de la terre et de l’environnement/A1A41 - Ingénieur-e biologiste en analyse de données
Poste ouvert aux : : Contractuels
Description du poste :
Vous serez impliqué.e dans un programme de recherche qui vise à comprendre la plasticité écologique des chauves-souris liée à leur adaptation au milieu urbain, et les conséquences sur les dynamiques d’infection. Pour cela, vous rejoindrez une étude en cours sur le Petit Molosse de La Réunion, une minuscule espèce de chauves-souris insectivore, emblématique et à caractère patrimonial, car elle est le seul mammifère indigène et endémique de l’île. Cette espèce s’est adaptée à l’urbanisation croissante de l’île de la Réunion et colonise aujourd’hui de nombreux habitats urbains. Elle est également étudiée depuis plusieurs années car elle naturellement infectée par plusieurs agents infectieux à potentiel zoonotique. Le projet a pour objectif de mesurer comment l’urbanisation peut altérer la physiologie et le comportement des chauves-souris, et en se focalisant sur trois paramètres dans des colonies de Petits Molosses situées dans des habitats plus ou moins urbanisés : les niveaux de stress, la composition du microbiote et celle du régime alimentaire. Pour cela, nous utiliserons des échantillons biologiques qui ont déjà été collectés et sont donc déjà disponibles dans l’unité PIMIT. Nous procéderons également à la collecte de nouveaux échantillons sur le terrain pour compléter l’échantillonnage. Les conséquences sur l’infection seront analysées à travers l’étude de la prévalence et la charge virale/bactérienne de plusieurs agents infectieux tels que les paramyxovirus, les coronavirus et les bactéries leptospires, dont les dynamiques d’infection sont suivies depuis plusieurs années dans l’unité. Ce projet combinera ainsi des questions d’éco-physiologie, d’écologie microbienne et d’épidémiologie en utilisant des approches de sérologie, biologie moléculaire et bioinformatique. Sous la direction de Muriel DIETRICH, Chargée de Recherche IRD dans l’UMR PIMIT, les missions seront de : - mesurer les niveaux de stress (quantité de cortisol) dans les urines de chauves-souris, par une méthode sérologique (kit ELISA commercial). - caractériser le microbiote bactérien et le régime alimentaire à partir des fèces de chauves-souris (préparation des échantillons en laboratoire et analyse bioinformatique), grâce à des techniques de séquençage au débit permettant de mesurer la diversité et la composition des communautés bactériennes et celles d’insectes consommées. - mesurer la charge virale et bactérienne par PCR pour plusieurs agents infectieux. - participer au terrain pour la collecte de nouveaux échantillons. - analyser avec des méthodes biostatistiques les variations spatio-temporelles du stress, du microbiote bactérien, du régime alimentaire et de l’infection, en relation avec le niveau d’urbanisation des colonies de Petits Molosses.

Nous recherchons un.e candidat.e très motivé.e, curieux.se et autonome, titulaire d’un doctorat en écologie, évolution et/ou épidémiologie. Le.la candidat.e devra avoir une expérience en écologie de la faune sauvage avec un profil recouvrant le terrain, le laboratoire et l’analyse de données. Nous recherchons en particulier des compétences sur le terrain (capture de chauves-souris, prélèvements biologiques sur faune sauvage), en laboratoire (sérologie, biologie moléculaire) et en analyses de données (biostatistiques + analyses bioinformatiques de données de séquençage Illumina). D'excellentes compétences en communication, tant à l'oral qu'à l'écrit, sont indispensables, de même que la capacité à interagir et à travailler au sein d'une équipe pluridisciplinaire.

2026-637 - Ingénieur d'études en techniques biologiques H/F

Wed, 02 Sep 2026 09:25:04 Z

Domaine / métier : SCIENCE - BAP A : Sciences du vivant, de la terre et de l’environnement/A2A43 - Ingénieur-e en techniques biologiques
Poste ouvert aux : : Titulaires
Description du poste :
Le candidat sera responsable de la mise en place de projets expérimentaux faisant appel à la biologie humaine et parasitaire. Il interviendra en amont dans la sélection des méthodes à mettre en œuvre et dans l'élaboration de protocoles. Sous la responsabilité de Gwladys Bertin, Responsable de l’Axe Laboratoire 5 activités principales : - Concevoir, conduire, développer et optimiser l'ensemble des expériences nécessaires à la réalisation de projets scientifiques intégrés de biologie moléculaire et cellulaire - Traiter les données (analyser, interpréter et valider les résultats) et participer à leurs valorisations - Rédiger des protocoles méthodologiques et des rapports d'expériences ou d'études. - Gérer le circuit des échantillons, des données obtenues et des analyses réalisées, en lien avec les cohortes de patients du laboratoire - Assurer une veille scientifique et technologique dans son domaine d'activité Activités secondaires : - Assurer la formation technique de stagiaires et étudiants des équipes. - Appliquer et faire appliquer les règles d’hygiène et de sécurité du domaine.

Vous avez développé les compétences suivantes : Savoir - Connaissance théorique et pratiques approfondie de la biologie cellulaire et moléculaire. - Connaissance en parasitologie et notamment sur le paludisme serait apprécié. - Connaissance des réglementations en matière d’hygiène et sécurité Savoir faire - Maitriser des techniques de biologie moléculaire, cellulaire et biochimie - Mettre en place des méthodes et des outils de suivi de projet - Maîtriser les outils informatiques de recueil et de traitement des données. - Assurer la gestion des stocks - Savoir appliquer et transmettre les bonnes pratiques de laboratoire. - Maîtriser les techniques de présentations (orales et écrites). - Maitriser l'anglais écrit et oral. Savoir être - Goût pour le travail en équipe - Rigueur et organisation - Sens du relationnel - Bonne communication écrite et orale - Esprit d'analyse et prise d'initiative

2026-790 - A1A41 - Ingénieur-e biologiste en analyse de données H/F

Mon, 03 Aug 2026 13:09:24 Z

Domaine / métier : SCIENCE - BAP A : Sciences du vivant, de la terre et de l’environnement/A1A41 - Ingénieur-e biologiste en analyse de données
Poste ouvert aux : : Contractuels
Description du poste :
Vous rejoindrez une équipe de recherche dynamique impliquée dans un projet européen visant à comprendre comment les caractéristiques moléculaires du moustique tigre, son microbiote et les conditions environnementales locales influencent sa capacité à transmettre les quatre sérotypes du virus de la dengue. Vous jouerez un rôle central dans l’analyse, l’intégration des données transcriptomiques et métagénomiques produites dans le cadre des différentes actions du projet TIGRUN. Ces données seront issues de plusieurs tissus du moustique, de différents temps post-infection, des quatre sérotypes du virus de la dengue et de populations naturelles provenant de plusieurs zones microclimatiques de La Réunion. Vos principales missions: -Concevoir, développer, optimiser et documenter des pipelines bioinformatiques reproductibles pour l’analyse de données de séquençage à haut débit Assurer le contrôle qualité, le prétraitement, l’alignement, la quantification et l’analyse statistique des données transcriptomiques issues des différents tissus et conditions expérimentales Conduire les analyses d’expression différentielle et contribuer à l’identification de signatures moléculaires, de voies biologiques et de réseaux de gènes associés à l’infection par les différents sérotypes du virus de la dengue Analyser les données de métagénomique shotgun afin de caractériser la diversité taxonomique et fonctionnelle des microbiotes associés aux populations naturelles d’Aedes albopictus Réaliser des analyses comparatives permettant d’étudier les variations du microbiote entre les localités, les conditions environnementales et les modalités de collecte des moustiques Intégrer les données transcriptomiques et métagénomiques aux métadonnées expérimentales, environnementales et entomologiques, notamment les tissus étudiés, les sérotypes viraux, les temps post-infection, les microclimats et les niveaux de compétence vectorielle Contribuer à l’interprétation biologique des résultats en interaction étroite avec les différents membres et partenaires scientifiques du projet Assurer la structuration, la documentation, la traçabilité et la gestion des données produites, dans le respect des principes de reproductibilité et de science ouverte ; Développer et maintenir un site web interactif destiné à la consultation et à la visualisation des données transcriptomiques et métagénomiques du projet par la communauté scientifique Contribuer à la rédaction d’articles scientifiques, de rapports techniques et de documents de valorisation Présenter les résultats lors de réunions de consortium, de séminaires et de congrès scientifiques nationaux et internationaux Participer au transfert de compétences en bioinformatique et à l’accompagnement des étudiants et personnels impliqués dans le projet. Ce poste vous permettra d’évoluer dans un environnement scientifique multidisciplinaire et international génomique, virologie, entomologie médicale, microbiologie et écologie de la santé.

Le profil que nous recherchons Formation Doctorat en bioinformatique, biologie computationnelle, génomique, biostatistique, biologie des systèmes ou dans une discipline apparentée. Compétences scientifiques et techniques Vous possédez idéalement plusieurs des compétences suivantes : - expérience confirmée dans le traitement et l’analyse de données issues du séquençage à haut débit ; - expertise en analyse de données transcriptomiques, notamment RNA-seq, contrôle qualité, quantification, normalisation et expression différentielle ; - expérience en métagénomique shotgun, en analyse de microbiomes ou dans le traitement de données métagénomiques ; - maîtrise avancée des environnements Linux et des langages de programmation utilisés en bioinformatique, notamment R, Python et Bash ; - solides compétences en statistiques appliquées aux données biologiques multidimensionnelles ; - maîtrise des outils de visualisation et d’interprétation des données génomiques et multi-omiques ; - connaissance des bases de données biologiques, des méthodes d’annotation fonctionnelle et des standards associés aux données omiques ; - expérience dans la conception de pipelines automatisés, documentés et reproductibles ; - capacité à structurer, documenter et gérer des jeux de données complexes et leurs métadonnées ; - connaissances en développement d’interfaces web, de bases de données ou d’applications interactives de visualisation appréciées ; - connaissances en virologie, microbiologie, entomologie médicale ou biologie des vecteurs appréciées. Qualités personnelles Vous êtes reconnu(e) pour : - votre rigueur scientifique et votre capacité d’analyse ; - votre autonomie, votre esprit d’initiative et votre sens de l’organisation ; - votre aptitude à conduire plusieurs analyses complexes dans le respect des échéances du projet ; - votre capacité à travailler à l’interface entre bioinformatique et biologie expérimentale ; - vos qualités rédactionnelles et votre aptitude à communiquer les résultats scientifiques à l’écrit comme à l’oral. Une bonne maîtrise de l’anglais scientifique est également attendue.