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2026-860 - Contrat doctoral - Dynamique des nutriments, oxygène et carbone dans l'océan Indien occidental H/F

Mon, 09 Nov 2026 15:23:09 Z

Domaine / métier : SCIENCE - Chercheurs-es/Doctorant-es
Poste ouvert aux : : Contractuels
Description du poste :
Objectif L’objectif général est de comprendre et de quantifier comment la circulation océanique et les processus physiques à fine échelle contrôlent le transport des nutriments et les cycles de l’oxygène et du carbone dans l’océan Indien occidental, ainsi que la réponse de ces mécanismes à la variabilité et au changement climatiques. Les travaux s’articuleront autour de trois objectifs complémentaires : Dynamique des nutriments et transport physique : Quantifier le rôle des tourbillons de mésoéchelle, des courants de bord, du mélange vertical et de la circulation induite par les îles dans la redistribution des nutriments et leur apport à la zone euphotique. Cycles de l’oxygène et du carbone : Étudier les mécanismes physiques et biologiques qui contrôlent la variabilité de l’oxygène et du carbone inorganique dissous, notamment la production primaire, la respiration, la reminéralisation, les échanges air–mer et l’export de carbone. Variabilité et changement climatiques : Évaluer comment le réchauffement, les modifications de la stratification et de la circulation influencent la disponibilité des nutriments, la ventilation en oxygène et la chimie du système carbonaté, en portant une attention particulière aux environnements régionaux et insulaires. Méthodologie La thèse s’appuiera sur le modèle couplé physique–biogéochimique CROCO–PISCES, à travers des configurations régionales emboîtées couvrant l’océan Indien occidental, Madagascar, le canal du Mozambique et les systèmes insulaires, notamment La Réunion–Maurice et les Comores–Mayotte. Les travaux combineront des simulations numériques à haute résolution, des analyses des bilans physiques et biogéochimiques, ainsi que des comparaisons entre modèles et observations, à partir de produits satellitaires et de mesures régionales in situ disponibles. Des simulations historiques et des expériences de régionalisation climatique seront utilisées pour étudier la variabilité actuelle et les évolutions futures potentielles. Une attention particulière sera portée à la distinction entre les contributions du transport physique et celles des transformations biologiques, ainsi qu’à l’identification des mécanismes dominants aux différentes échelles spatiales et temporelles. Résultats attendus Ce projet permettra d’améliorer notre compréhension des mécanismes physiques qui contrôlent la disponibilité des nutriments et les cycles de l’oxygène et du carbone dans l’océan Indien occidental. Il fournira des évaluations quantitatives de la variabilité biogéochimique régionale et de sa sensibilité au changement climatique, contribuant ainsi aux futures études sur l’acidification, la désoxygénation et la vulnérabilité des habitats marins.

Vous avez développé les compétences suivantes : Solides connaissances en océanographie physique, dynamique des fluides et biogéochimie marine. Bonne compréhension de la circulation océanique, des cycles des nutriments et de la dynamique du plancton. Compétences en programmation scientifique (Python, Fortran). Expérience en analyse de données scientifiques, visualisation et méthodes statistiques. Solides bases en mathématiques et méthodes numériques. Expérience des modèles de circulation océanique (CROCO, ROMS, NEMO ou MITgcm). Familiarité avec les modèles biogéochimiques marins (PISCES, ECO3M ou équivalents). Connaissance des processus océaniques de mésoéchelle et de sous-mésoéchelle. Expérience des environnements Linux, du calcul haute performance (HPC) et du calcul parallèle. Familiarité avec les observations satellitaires, les données océanographiques et les méthodes de validation des modèles. Vous faites preuve des qualités humaines suivantes : Solides capacités d’analyse et de résolution de problèmes. Curiosité scientifique, autonomie et volonté d’apprendre. Aptitude à travailler en équipe dans un environnement de recherche international. Bonnes capacités de communication scientifique en anglais. Niveau B2-C1 Vous êtes titulaire d’un diplôme de niveau 7 Master ou diplôme d’ingénieur dans les domaines suivants : océanographie physique, dynamique des fluides et biogéochimie marine L’IRD, au cours de votre parcours professionnel, vous accompagne dans le développement de vos compétences. L’institut met à votre disposition un panel d’outils tel que le parcours digital d’intégration, l’accès à la formation permanente, à la promotion et la mobilité. L’IRD offre, en fonction des activités, la possibilité de télétravailler de 1 à 3 jours hebdomadaires. En rejoignant l’IRD, vous bénéficierez : De 32 jours de congés + 13 RTT (pour un temps plein à 38h30 hebdomadaire). Une restauration collective. Souscription annuelle (facultative) à l’Association des Œuvres Sociales : prestations vacances-loisirs et sportives-culturelles. D’une affiliation à la protection sociale complémentaire MGEN, offrant une couverture santé et prévoyance de qualité. D’un cadre de travail agréable, proche de la nature, desservi par le Tram ligne 5 et accessible en vélo et bénéficiant d’un système de co-voiturage (convention mobilité signée avec la métropole). Nos recrutements sont fondés sur les compétences, sans distinction d’origine, d’âge ou de genre et tous nos postes sont ouverts aux personnes en situation de handicap.

2026-858 - Contrat Doctoral en IA pour la régulation génique chez les plantes H/F

Wed, 04 Nov 2026 08:29:52 Z

Domaine / métier : SCIENCE - Chercheurs-es/Doctorant-es
Poste ouvert aux : : Contractuels
Description du poste :
Sous la responsabilité de deux directeurs de recherche et co-encadrants de cette thèse, l’objectif de votre thèse sera de viser à prédire l'expression des gènes chez les plantes, en couplant des modèles de langage génomiques et l'apprentissage sur graphes de régulation génique (projet BioLLM-CRE). vos activités seront les suivantes : Constituer un jeu de données de référence associant éléments cis-régulateurs et profils d'expression spatio-temporelle chez Arabidopsis et le riz. Évaluer des modèles de langage génomiques, généralistes et spécialisés plantes, pour la prédiction de l'expression, en les comparant à des approches d'apprentissage automatique classiques. Concevoir des modèles d'apprentissage sur graphes (GNN, Graph Transformers) intégrant ces représentations de séquence dans les réseaux de régulation génique. Interpréter les modèles pour identifier les modules régulateurs déterminants, et évaluer leur transfert vers d'autres céréales. Valoriser les résultats : publications, conférences internationales, rédaction du manuscrit de thèse. Diffuser le benchmark, le code et les modèles en open source. Participer à la vie scientifique de l'unité (séminaires, formations doctorales). Votre future équipe Vous rejoindrez un collectif interdisciplinaire de l'UMR DIADE associant bioinformatique et intelligence artificielle (modèles fondationnel en génomique) et biologie du développement racinaire. Vous aurez accès à des moyens de calcul intensif (GPU) et à un environnement de recherche international.

Vous avez développé les compétences suivantes : Maîtrise de Python et d'un framework d'apprentissage profond (PyTorch). Connaissances en apprentissage automatique et en deep learning (Transformers, apprentissage de représentations). Notions en apprentissage sur graphes (PyTorch Geometric, DGL) et en modèles de langage (Hugging Face) appréciées. Connaissances en génomique et en manipulation de données de séquençage (formats NGS, outils bioinformatiques). Anglais scientifique, à l'écrit comme à l'oral Niveau B2-C1. Vous faites preuve des qualités humaines suivantes : Curiosité scientifique et goût pour l'interdisciplinarité (informatique et biologie végétale). Autonomie et rigueur. Esprit d'équipe et aisance relationnelle. Capacités de synthèse et de rédaction. Persévérance et capacité d'adaptation. Vous êtes titulaire d'un diplôme de niveau 7 (Master ou diplôme d'ingénieur) dans les domaines suivants : bioinformatique, informatique (IA, apprentissage automatique), biologie computationnelle. L’IRD, au cours de votre parcours professionnel, vous accompagne dans le développement de vos compétences. L’institut met à votre disposition un panel d’outils tel que le parcours digital d’intégration, l’accès à la formation permanente, à la promotion et la mobilité. L’IRD offre, en fonction des activités, la possibilité de télétravailler de 1 à 3 jours hebdomadaires. En rejoignant l’IRD, vous bénéficierez : De 32 jours de congés + 13 RTT (pour un temps plein à 38h30 hebdomadaire). Une restauration collective. Souscription annuelle (facultative) à l’Association des Œuvres Sociales : prestations vacances-loisirs et sportives-culturelles. D’une affiliation à la protection sociale complémentaire MGEN, offrant une couverture santé et prévoyance de qualité. D’un cadre de travail agréable, proche de la nature, desservi par le Tram ligne 5 et accessible en vélo et bénéficiant d’un système de co-voiturage (convention mobilité signée avec la métropole). Nos recrutements sont fondés sur les compétences, sans distinction d’origine, d’âge ou de genre et tous nos postes sont ouverts aux personnes en situation de handicap.

2026-843 - Chargé des affaires juridiques H/F

Wed, 14 Oct 2026 15:24:11 Z

Domaine / métier : APPUI - Ressources Humaines et Affaires Juridiques/J2F53 - Chargé-e des affaires juridiques
Poste ouvert aux : : Contractuels
Description du poste :
Le/la chargé.e des affaires juridiques contentieux et règlementation générale assure une mission générale de conseil et d’expertise juridique et sur toutes questions réglementaires aux différentes structures de l’Institut et dans la gestion des précontentieux et contentieux. Il/Elle doit garantir la sécurité juridique et la défense des intérêts de l’Institut en France et sur l’ensemble de ses implantations géographiques. Sous la responsabilité de la directrice et de la directrice adjointe, vos activités seront les suivantes : En matière de réglementation générale, mettre en place la réglementation interne, veiller au respect des obligations juridiques et assurer la sécurité juridique des actes de l’IRD, accompagner juridiquement les structures dans la mise en place de réglementations spécifiques à leur domaine, assurer une veille réglementaire, rédiger des actes juridiques (décisions administratives, des projets de délibérations, etc.). En matière d’expertise, assurer une mission générale d’expertise, de conseil, d’avis et d’aide à la décision auprès de la gouvernance et des responsables de structures, des services sur toutes questions juridiques, anticiper et analyser l’impact des évolutions légales et réglementaires applicables à l’Institut pour appuyer les décisions et accompagner l’action, fournir des informations et des conseils argumentés sur la règle applicable à une situation donnée ; rédiger des notes, des études juridiques et rédiger des actes juridiques courants. En matière contractuelle, expertise des contrats relevant du droit public ou du droit privé. En matière contentieuse et précontentieuse, gérer l’ensemble des précontentieux et contentieux de l’IRD en lien avec les structures concernées (directions, délégations régionales, représentations, etc.), assurer la défense des intérêts de l’Institut devant les différents ordres de juridiction et en lien avec les auxiliaires de justices, le cas échéant. En matière de formation et d’information, partager, valoriser et diffuser l’information et le savoir juridique à travers la mise en place de formations et d’outils de communication afin de développer la culture juridique. Participe aux dossiers transversaux portés par la direction.

Vous avez développé les compétences suivantes : Maîtriser le droit public français notamment le droit administratif, le droit de la Fonction publique, la responsabilité administrative, le droit de la commande publique, maîtriser la loi dite « Sapin 2 », maîtriser le droit du contentieux public et avoir de bonnes notions en droit du contentieux privé français, posséder une très bonne culture juridique de l’ensemble des branches du droit et intégrer les contraintes juridiques locales (application du droit local à l’étranger), Savoir rédiger un mémoire en défense, maîtriser les techniques du raisonnement juridique, préparer un argumentaire juridique, conduire des négociations sur les précontentieux et assurer la défense juridique d’un établissement, Savoir tirer les conséquences des dossiers traités, évaluer un risque juridique pour l’établissement en matière contentieuse, élaborer, et mettre en œuvre des procédures administratives, préparer un argumentaire juridique et exploiter des sources de données documentaires, Savoir vulgariser le droit et savoir rendre compte auprès de sa direction (tableaux de bord et de suivi de l’activité, etc.), Posséder une capacité d’adaptation permettant de prendre en charge des missions relevant d’un périmètre élargi, Connaître le statut des EPST et plus généralement l’organisation, le fonctionnement et les circuits de décision de la recherche publique. Vous faites preuve des qualités humaines suivantes : Rigueur, autonomie, adaptabilité, discrétion, écoute, qualité relationnelle.